Die Abwasserreinigungsanlage Altdorf weist eine Kapazität von 64'000 Einwohnerwerten auf. Sie verfügt damit über die notwendigen Ressourcen das gesamte Abwasser des Kantons Uri aufzunehmen und auf sehr hohem Niveau zu reinigen. Die ARA Altdorf reinigt das Abwasser zuerst mittels physikalischen resp. mechanischen Prozessen wie Rechenanlagen, Sand- und Fettfang sowie dem Vorklärbecken. Anschliessend durchläuft es die biologische Reinigungsstufe, bevor es als klares Wasser die ARA wieder verlässt und direkt in den Urnersee geleitet wird. Gegen 2030 wird die ARA Altdorf voraussichtlich mit einer weiteren Reinigungsstufe ausgerüstet. Diese dient dazu, Mikroverunreinigungen wie Medikamentenrückstände aus dem Abwasser zu eliminieren.